原理非常简单
■ mouseenter和mouserleave事件
■ 获取DOM内容
■ 获取坐标
■ body追加内容并定位
然而,这并没有什么卵用。
首先添加@回复,下面的代码加到  functions.php 中

add_filter('comment_text', 'comment_add_at_parent');
function comment_add_at_parent($comment_text)
{
    $comment_ID = get_comment_ID();
    $comment    = get_comment($comment_ID);
    if ($comment->comment_parent) {
        $parent_comment = get_comment($comment->comment_parent);
        $comment_text  = preg_replace('/<a href="#comment-([0-9]+)?".*?>(.*?)<//a>/i','',$comment_text);//去除存在数据库里的@回复
        $comment_text   = '<a href="#comment-' . $comment->comment_parent . '" rel="nofollow" data-id="' . $comment->comment_parent . '" class="cute atreply">@' . $parent_comment->comment_author . '</a> ' . $comment_text;
    }
    return $comment_text;
}

注意你的评论内容是否有  id="#comment-12345" 这样的  div 包裹,如果没有要自行在回调函数中加上。一般标准主题都是有这个的。
然后就是纯JS操作了,加到你的js文件中。

jQuery(document).on("mouseenter", ".atreply",
function(e) {
    e.preventDefault();
    var __this = jQuery(this),
    __id = __this.data('id'),
    left = __this.offset().left,
    top = __this.offset().top,
    __html = jQuery('#comment-' + __id).html(),
    content = '<div class="popover">' + __html + '</div>';
    jQuery('body').append(content);
    jQuery('.popover').css({
                    "left": (left - 15),
                    "top": (top + 15)
                });
});
jQuery(document).on("mouseleave", ".atreply",
function(e) {
    jQuery('.popover').remove();
});

随便弄点css

.popover{background-color:#fff;
border:1px solid #eee;
position:absolute;
max-width:300px;
padding:10px;}